Для проветривания в хорошую погоду, в те часы, когда на дворе холоднее, чем в хранилище (ночью и особенно по утрам, перед восходом солнца), открывают наружную глухую дверь. Крайне желательна принудительная электровентиляция.
В хранилище загружают в основном зимние сорта яблок (но при условии искусственного охлаждения можно хранить летние и осенние сорта), достигшие съемной зрелости.
Удобнее всего хранить яблоки в сквозных (со щелями) ящиках стандартного размера, устанавливая их штабелями в несколько рядов. Для лучшего проветривания нижние ряды ящиков устанавливают не прямо на пол, а на брусья и оставляют небольшие промежутки между ящиками в штабелях. Между штабелями и стенами помещения, а также между отдельными штабелями оставляют узкие проходы от 50 до 70 см шириной. ЯЩИКИ предварительно обеззараживают.
При самых лучших условиях хранения яблок все же происходит постепенная убыль их в весе, которая объясняется дыханием плодов и испарением воды с их поверхности. Предельные нормы этой естественной убыли при длительном хранении установлены следующие (по месяцам хранения): сентябрь —2,5%, октябрь —1,8, ноябрь —1,5, декабрь —1,3, январь —1,0, февраль —0,5, март —0,4, апрель —0,3, май —0,3%.
Убыль тем больше, чем выше температура в хранилище и чем меньше относительная влажность воздуха.
Отдельные поврежденные или помятые плоды, положенные по недосмотру сортировщика в ящики, загнивают и могут заразить соседние. Чтобы предупредить серьезные потери, необходимо через каждые две недели тщательно просматривать часть ящиков и, если в них действительно окажутся загнившие яблоки, провести переборку всех ящиков данной партии. Обычно, если все операции по сбору, сортировке, укладке и хранению плодов были сделаны правильно, то количество испорченных не превышает 1,5%, что составит вместе с «угаром» не более 11 —12% от общего веса яблок, заложенных на длительное хранение.